Bioinformatika: Aký je rozdiel medzi zarovnaním jedného rýchleho čítania na STAR a vyrovnaním dvoch rýchlych čítaní na STAR medzi sebou? http://www.genefriends.org/RNAseqForDummies/


Odpoveď 1:

Čo myslíš jedným rýchlym alebo dvoma rýchlym? Myslíte si, že čítate na jednom konci alebo na párovanom konci? Vždy sa môžete dozvedieť rozdiel medzi efektívnosťou jedného konca a účinnosťou spárovaného konca sekvencie. Je to kvôli zachyteniu a pokrytiu a scvrkáva sa na oveľa presnejšiu znalosť transkriptov s menším počtom artefaktov a falošných pozitív.